1959年，南航設(shè)立了“解算裝置”專業(yè)，是全國最早設(shè)立計(jì)算機(jī)專業(yè)的高校之一。1983年正式成立計(jì)算機(jī)工程系，2010年11月，經(jīng)學(xué)校批準(zhǔn)，成立計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，下設(shè)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系、信息安全系、軟件工程系、物聯(lián)網(wǎng)工程系、計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)部和計(jì)算中心等系部。學(xué)院現(xiàn)有教職工85人，其中專任教師72人，博導(dǎo)23人(含兼職)，教授19人，副教授37人。在校學(xué)生1464人，其中本科生947人，研究生517人。學(xué)院現(xiàn)有計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)、博士后流動(dòng)站，擁有計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)、計(jì)算機(jī)軟件與理論、計(jì)算機(jī)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)三個(gè)碩士點(diǎn)，設(shè)有計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、信息安全、軟件工程、物聯(lián)網(wǎng)工程四個(gè)本科專業(yè)。計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè)為江蘇省特色專業(yè)。近兩年來，學(xué)院獲評(píng)省級(jí)以上精品課程（群）3個(gè)，編寫國家“十一五”規(guī)劃教材1部、江蘇省精品教材1部，承擔(dān)江蘇省教改項(xiàng)目2項(xiàng)。
　　“十一五”以來，學(xué)院年均承擔(dān)國家863、973項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金、國防預(yù)研項(xiàng)目、航空基金以及省部委下達(dá)項(xiàng)目、橫向合作項(xiàng)目和各類攻關(guān)項(xiàng)目30余項(xiàng)，年均科研到款800余萬元，獲得省部級(jí)以上科技成果獎(jiǎng)8項(xiàng)，發(fā)表學(xué)術(shù)論文被三大檢索收錄395篇。